AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper

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Repository to help gather and map metadata from different sources

Sterne: 0
Forks: 2
Offene Anfänger-Issues: 0
Indexierte Issues: 37
Ø Merge: 1 T. 7 Std.
Gemergte PRs (30 T.): 1

Vorherrschende Sprache: Python
Lizenz: MIT
Letzter GitHub-Push: 11.9.2026
Zuletzt indexiert: 13.9.2026
Beitragsleitfaden: Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex: Verhaltenskodex
Anfänger-Labels: Keine Anfänger-Labels indexiert

Offen Alle

Bisher 36 offene Issues indexiert

Extract metadata from mesoscope rig acquisition files Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#24 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Stimulus epoch generation for multiplane ophys sessions Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#89 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
example script for U19 ETL Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#94 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Optimize Integration Tests Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#107 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Integration test for Bruker package Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#108 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Integration Test for FIP package Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#109 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add Rewards Behavior to stim epochs based on Saskia's Feedback Offen

enhancement

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#150 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add CamstimEphysEtl to Gather Metadata Offen

question

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#176 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Create timestamps.npy file for unaligned data Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#180 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Remove ml and ap fov coords from mesoscope session object Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#197 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Power in mW to the session.json Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#224 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Behavior stimulus table should include passive time period Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#243 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Installation fails on macOS with Python 3.13 due to wavpack-numcodecs compatibility Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#261 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add support for Python 3.12 and 3.13 testing Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#263 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
fix: photostimulation trials mislabeled as spontaneous Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#295 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add support for optogenetic FIP sessions and improve file pattern detection Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#298 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add session_type to Bergamo session model Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#299 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add stimulus epoch for bci single neuron stim control Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#306 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Define datasets for integration testing of metadata mapper Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#308 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add a new behavior type for Bergamo Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#309 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Modify mesoscope metadata mapper for deepdive data Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#320 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Port pavlovian behavior extractor to aind-metadata-extractor Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#331 · 5 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Port open ephys extractor to aind-metadata-extractor Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#332 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Port dynamic routing extractor to aind-metadata-extractor Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#335 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Port bruker extractor to aind-metadata-extractor Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#336 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Update SmartSPIM acquisition to accommodate laser calibration Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#343 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
multiplane-ophys QC z-drift local stack Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#370 · 4 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add laser power mapping for each mesoscope plane Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#372 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add functionality to ingest extracted output from Opto Fiber Benchmark epxerimental workflow and pass to mapper Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#410 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Update fip mapper to use `acquisition_type` Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#414 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Update FIP mapper to use passed patch_cable to fiber connection info Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#416 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Multiplane-ophys V2: Map the mesoscope extracted data to an acquisition file Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#438 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
GatherMetadataJob should accept multiple instrument_ids and ensure alphabetical order when merging Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#448 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
GathereMetadataJob should automatically populate curriculum fields in StimulusEpoch Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#465 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
GatherMetadataJob should raise an error when subject.sex or subject.genotype are null Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#479 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
BaseMapper incorrectly cited in readme Offen

AllenNeuralDynamics/aind-metadata-mapper#483 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026

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