stan-dev / stan-dev/rstan

Updated R to 3.6 and all hell broke loose

Đang mở
#653 13 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Ngôn ngữ chính
R
Star
1.1k
Fork
266
Merge trung bình
2 giờ 56 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
1

Mô tả

Summary:

Updated R and Rstudio, and all hell broke loose

Description:

I've been running the rethinking package, which uses rstan, for about 6 months - no problem. I updated R today, and all of a sudden things have gone haywire.

I uninstalled and re-installed rstan (and all other packages, for that matter), including updating Rtools. No luck. When I try to run the schools example directly from the Rstan "getting started" page, I get the error listed below

The C++ toolchain passes the test
I have also tried disabling the C++ toolchain configuration (which is noted to sometimes cause problems). No luck. Exact same issue.

I have de-installed and re-installed from scratch (R, then Rstan, then other toolboxes), but still no luck.

Any advice would be GREATLY appreciated. BTW - I'm just an ordinary scientist, not a developer or c-scientist ...so I would appreciate advice being "dummed down" as much as possible. TIA

Reproducible Steps:

Followed the steps on the Get Started page EXACTLY

Current Output:

Error in compileCode(f, code, language = language, verbose = verbose) :
Compilation ERROR, function(s)/method(s) not created! In file included from C:/Users/schwa/Documents/R/win-library/3.6/BH/include/boost/random/detail/integer_log2.hpp:19:0,
from C:/Users/schwa/Documents/R/win-library/3.6/BH/include/boost/random/detail/int_float_pair.hpp:26,
from C:/Users/schwa/Documents/R/win-library/3.6/BH/include/boost/random/exponential_distribution.hpp:27,
from C:/Users/schwa/Documents/R/win-library/3.6/BH/include/boost/random/gamma_distribution.hpp:25,
from C:/Users/schwa/Documents/R/win-library/3.6/StanHeaders/include/stan/math/prim/mat/prob/dirichlet_rng.hpp:5,
from C:/Users/schwa/Documents/R/win-library/3.6/StanHeaders/include/stan/math/prim/mat.hpp:276,
from C:/Users/schwa/Documents/R/win-library/3.6/StanHeaders/include/stan/math/rev/mat.hpp:12,
from C:/Users/schwa/Documents/R/win-library/3.6/StanHeaders/include/stan/math.hpp:4,

Error in sink(type = "output") : invalid connection

Expected Output:
RStan Version:

The version of RStan you are running (e.g., from packageVersion("rstan"))

R Version:

2.18.12

Operating System:

Windows 10

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách tái hiện ví dụ schools từ trang RStan Get Started trên Windows 10, sử dụng các phiên bản R, RStan, Rtools và RStudio được báo cáo. Kiểm tra đầu ra của trình biên dịch bắt đầu bằng các đường dẫn Boost và StanHeaders, sau đó so sánh kết quả với cấu hình toolchain được ghi lại. Hoàn tất nghĩa là xác định được sự không khớp của môi trường hoặc lỗi biên dịch và xác nhận một ví dụ hoạt động.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Đánh giá

Công nghệ
r
Lĩnh vực
build-system
Loại issue
Lỗi
Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức phù hợp với người mới
20/100

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.