ggtree support
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- 主要言語
- R
- スター
- 2.7k
- フォーク
- 641
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
説明
Hello everyone. I wanted to plot a phylogeny tree thanks to ggtree R package. Yet, I have too many species (around 1000) and the graph is unreadable. Thus, I wanted to convert the plot into plotly format to be able to zoom in. But I got this error message (see below).
Thank you for your help !
tree = read.tree("ressources/phylogeny_tree.tree")
p <- ggtree(tree, layout = "circular") +
geom_tiplab(size = 2) +
theme_tree2()
ggplotly(p)
5: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues
6: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues
コントリビューションガイド
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
調査の方向性
提供された R の例と ggplotly() のエントリポイントから始め、geom_GeomTextGGtree に対する geom2trace.default() の警告を追跡します。完了条件は、未実装の geom に関する警告なしに ggtree プロットが Plotly に変換され、ズーム可能な状態が維持されることです。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
評価
- 技術スタック
- r
- 領域
- data-visualization
- issue の種類
- 機能追加
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 活発さ
- 停滞
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 初心者へのやさしさ
- 35/100