ggtree support
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- 主要语言
- R
- 星标
- 2.7k
- 派生
- 641
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
描述
Hello everyone. I wanted to plot a phylogeny tree thanks to ggtree R package. Yet, I have too many species (around 1000) and the graph is unreadable. Thus, I wanted to convert the plot into plotly format to be able to zoom in. But I got this error message (see below).
Thank you for your help !
tree = read.tree("ressources/phylogeny_tree.tree")
p <- ggtree(tree, layout = "circular") +
geom_tiplab(size = 2) +
theme_tree2()
ggplotly(p)
5: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues
6: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues
贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue,再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库,在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request,并在描述里引用这个 Issue 编号。
调研方向
从提供的 R 示例和 ggplotly() 入口点开始,然后追踪 geom_GeomTextGGtree 的 geom2trace.default() 警告。完成的标准是:ggtree 图能够转换为 Plotly,且不再出现未实现 geom 的警告,并保持可缩放。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
评估
- 技术栈
- r
- 领域
- data-visualization
- Issue 类型
- 功能
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 活跃度
- 停滞
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 新手友好度
- 35/100