ggtree support
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- Langage dominant
- R
- Étoiles
- 2.7k
- Forks
- 641
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Description
Hello everyone. I wanted to plot a phylogeny tree thanks to ggtree R package. Yet, I have too many species (around 1000) and the graph is unreadable. Thus, I wanted to convert the plot into plotly format to be able to zoom in. But I got this error message (see below).
Thank you for your help !
tree = read.tree("ressources/phylogeny_tree.tree")
p <- ggtree(tree, layout = "circular") +
geom_tiplab(size = 2) +
theme_tree2()
ggplotly(p)
5: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues
6: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues
Guide de contribution
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Par où commencer
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Piste de recherche
Commencez par l’exemple R fourni et le point d’entrée ggplotly(), puis remontez jusqu’à l’avertissement de geom2trace.default() pour geom_GeomTextGGtree. C’est terminé lorsque le graphique ggtree est converti en Plotly sans l’avertissement concernant un geom non implémenté et reste zoomable.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Évaluation
- Stack technique
- r
- Domaine
- data-visualization
- Type d'issue
- Fonctionnalité
- Difficulté
- 4/5
- Temps estimé
- 3-5 jours
- Activité
- À l'abandon
- Clarté
- Plutôt claire
- Accessibilité débutants
- 35/100