ggtree support
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- Lingua principale
- R
- Stelle
- 2.7k
- Fork
- 641
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Descrizione
Hello everyone. I wanted to plot a phylogeny tree thanks to ggtree R package. Yet, I have too many species (around 1000) and the graph is unreadable. Thus, I wanted to convert the plot into plotly format to be able to zoom in. But I got this error message (see below).
Thank you for your help !
tree = read.tree("ressources/phylogeny_tree.tree")
p <- ggtree(tree, layout = "circular") +
geom_tiplab(size = 2) +
theme_tree2()
ggplotly(p)
5: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues
6: In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextGGtree() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues
Guida per i contributori
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Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
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- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Direzione di ricerca
Inizia con l’esempio R fornito e il punto di ingresso ggplotly(), quindi risali all’avviso di geom2trace.default() per geom_GeomTextGGtree. Il lavoro è completato quando il grafico ggtree viene convertito in Plotly senza l’avviso relativo a un geom non implementato e rimane zoomabile.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Valutazione
- Stack tecnologico
- r
- Ambito
- data-visualization
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Stato di attività
- Ferma
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Idoneità per principianti
- 35/100