navinlabcode/CellTrek

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スター: 135
フォーク: 23
オープンの初心者向け issue: 0
索引済み issue: 28

主要言語: R
ライセンス: ライセンスのデータがありません
最終 GitHub push: 2026年8月23日
最新の索引: 2026年9月19日
コントリビューションガイド: コントリビューションガイドがありません
行動規範: 行動規範がありません
初心者向けラベル: 初心者向けラベルは索引されていません
PR マージ指標: 30日以内にマージされた PR はありません

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オープンの issue を 28 件索引しました

CellTrek on other spatial data, like cosmx SMI data or stereo-seq data. オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#46 · 2025年5月29日に作成
Single cell data and spatial data matching requirement オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 20/100

navinlabcode/CellTrek#44 · 2024年12月3日に作成
Using Celltrek on non-matching data ST and SC data. オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#42 · 2024年5月27日に作成
[Question] Is it possible to superimpose a network on spatial image? オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

navinlabcode/CellTrek#41 · 2024年5月16日に作成
Error: package or namespace load failed for ‘CellTrek’ オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#40 · 2024年3月26日に作成
Error in rownames(st_data[[st_assay]]@data) : no slot of name "data" for this object of class "Assay5", Possible Seurat v5.0 error オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#39 · コメント 8 件 · 2023年12月28日に作成
ERROR オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#38 · コメント 1 件 · 2023年12月16日に作成
celltrek_vis Error オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#37 · 2023年12月13日に作成
Errors in CellTrek::traint on example data from README オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

navinlabcode/CellTrek#36 · コメント 4 件 · 2023年11月3日に作成
Customized Plot オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

navinlabcode/CellTrek#34 · 2023年9月22日に作成
Normalization methods オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 15/100

navinlabcode/CellTrek#33 · リアクション 1 件 · 2023年9月21日に作成
Request for cell type annotation of mouse kidney and DCIS1 datasets オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#32 · 2023年9月21日に作成
Dealing with spatial data with merged samples オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

navinlabcode/CellTrek#31 · 2023年7月26日に作成
Celltrek output to spot and cell mapping オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 20/100

navinlabcode/CellTrek#30 · 2023年7月5日に作成
"Celltrek"_Simualtion dataset オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 15/100

navinlabcode/CellTrek#29 · 2023年5月15日に作成
lack of single-cell transcriptome data from the same patient オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

navinlabcode/CellTrek#28 · コメント 1 件 · 2023年5月6日に作成
keep raw data in celltrek object オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

navinlabcode/CellTrek#25 · コメント 1 件 · 2022年10月13日に作成
celltrek_vis error オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

navinlabcode/CellTrek#24 · コメント 1 件 · 2022年10月12日に作成
Error while running CellTrek:celltrek function オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#23 · コメント 1 件 · 2022年10月4日に作成
Error: 'DT_boot_mst' is not an exported object from 'namespace:CellTrek' オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 30/100

navinlabcode/CellTrek#22 · 2022年9月17日に作成
Assigning all single cells オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#21 · コメント 1 件 · 2022年8月28日に作成
clarification on overall method オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#20 · コメント 2 件 · 2022年8月12日に作成
Error: invalid character indexing オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#19 · コメント 1 件 · 2022年8月2日に作成
Question about Supplementary Figure 7e オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#16 · コメント 1 件 · 2022年7月5日に作成
How to keep all the metadata from the seurat traint object after running CellTrek::celltrek() オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

navinlabcode/CellTrek#15 · コメント 1 件 · 2022年7月1日に作成
Visualization and error in celltrek_vis オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#14 · コメント 3 件 · 2022年6月9日に作成
Some cells are missing from output オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

navinlabcode/CellTrek#13 · コメント 4 件 · 2022年5月24日に作成
Coembedding shows batch effect オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

navinlabcode/CellTrek#12 · コメント 4 件 · 2022年5月16日に作成

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