repo.status() appears to be broken?

I'm running repo.status().items() in a pre-commit hook using the -a flag (git commit -a -m "Test"), and I get a result that looks like this:

[('config/git_hooks/pre-commit', 256), ('bin/run_flake8', 256)]

If I run git status in that same process, I get:

On branch ops_1331_fix
Your branch is ahead of 'origin/ops_1331_fix' by 2 commits.
  (use "git push" to publish your local commits)
Changes to be committed:
  (use "git reset HEAD <file>..." to unstage)

    modified:   bin/run_flake8
    modified:   config/git_hooks/pre-commit

In other words, pygit2 is reporting those files as not being staged, and git is reporting them as being staged. Why the discrepancy?

まず、git commit -a を使用しているときの pre-commit hook で repo.status().items() による不一致を再現し、次にその結果を、一覧にある 2 つのファイルについての git status の結果と比較します。pygit2 status API と関連する libgit2 の動作を確認します。ステージされたファイルが status 256 を受け取る理由を説明し、それがバグである場合は不一致を修正できれば完了です。