repo.status() appears to be broken?

I'm running repo.status().items() in a pre-commit hook using the -a flag (git commit -a -m "Test"), and I get a result that looks like this:

[('config/git_hooks/pre-commit', 256), ('bin/run_flake8', 256)]

If I run git status in that same process, I get:

On branch ops_1331_fix
Your branch is ahead of 'origin/ops_1331_fix' by 2 commits.
  (use "git push" to publish your local commits)
Changes to be committed:
  (use "git reset HEAD <file>..." to unstage)

    modified:   bin/run_flake8
    modified:   config/git_hooks/pre-commit

In other words, pygit2 is reporting those files as not being staged, and git is reporting them as being staged. Why the discrepancy?

Beginnen Sie damit, die Abweichung mit repo.status().items() im pre-commit hook bei Verwendung von git commit -a zu reproduzieren; vergleichen Sie anschließend dessen Ergebnis mit git status für die beiden aufgeführten Dateien. Lesen Sie die pygit2 status API und das zugehörige libgit2-Verhalten; abgeschlossen ist die Aufgabe, wenn erklärt wird, warum gestagte Dateien den Status 256 erhalten, und die Abweichung korrigiert wird, falls es sich um einen Fehler handelt.