biocore/LabControl

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lab manager for plate maps and sequence flows

Sterne: 2
Forks: 15
Offene Anfänger-Issues: 0
Indexierte Issues: 123

Vorherrschende Sprache: Python
Lizenz: BSD-3-Clause
Letzter GitHub-Push: 12.9.2019
Zuletzt indexiert: 14.9.2026
Beitragsleitfaden: Kein Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex: Kein Verhaltenskodex
Anfänger-Labels: Keine Anfänger-Labels indexiert
PR-Merge-Kennzahlen: Keine gemergten PRs in 30 T.

Offen Alle

Bisher 123 offene Issues indexiert

Add parameter to track number of times a lot, primer plate, etc is used and a way to warn if too many uses Offen

feature request scope:large

biocore/LabControl#31 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Highlight cells per study Offen

feature request scope:medium

biocore/LabControl#52 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Implement repooling functionality Offen

feature request scope:large

biocore/LabControl#53 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Create an interface that, given a plate, provides its ancestry and descendency Offen

feature request priority:medium scope:large

biocore/LabControl#77 · 11 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Refactor backend to rename 16S to amplicon Offen

code refactor scope:medium

biocore/LabControl#91 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Add comment box in gDNA plate extraction Offen

feature request scope:medium

biocore/LabControl#128 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Implement unit tests for javascript functionality Offen

code refactor priority:high scope:large

biocore/LabControl#171 · 4 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
Stress test the software Offen

enhancement priority:high scope:large

biocore/LabControl#173 · 7 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Idea: Is there any way to integrate a biosafetly level warning button that goes away once the samples are extracted? Offen

feature request scope:unknown

biocore/LabControl#179 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
export all plate maps from a single study to a tsv/excel file Offen

feature request scope:unknown

biocore/LabControl#190 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Ensure that data duplication by "contents" field in sample_composition is acceptable Offen

code refactor priority:high scope:large

biocore/LabControl#220 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Add ENV_package to sample sheet Offen

feature request priority:high scope:medium

biocore/LabControl#227 · 22 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Make a more generalized 'upstream' connector in composition objects/tables? Offen

code refactor scope:large

biocore/LabControl#234 · 11 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Change sample sheet Sample_ID and Sample_Name to use actual sample id instead of sample "content"? Offen

enhancement scope:small wontfix

biocore/LabControl#237 · 5 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Add comments to multiple wells based on selection Offen

feature request scope:large

biocore/LabControl#244 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Add tooltips to pooling interface to explain parameter values Offen

feature request front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#249 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
for gDNA plate compression, add diagram to output Offen

feature request scope:medium

biocore/LabControl#252 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Prevent creation of sequencing runs without all lanes filled Offen

feature request scope:small wontfix

biocore/LabControl#261 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Consolidate "components" attribute logic in PoolingProcess and PoolComposition Offen

code refactor priority:low scope:small

biocore/LabControl#265 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Move definition of number of lanes per sequencer into database from SequencingProcess Offen

code refactor priority:low scope:medium

biocore/LabControl#266 · 6 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
View, modify, and search well contents of multiple plates at same time during sample plating Offen

feature request priority:medium scope:large

biocore/LabControl#285 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Add Primer Date selection in Prepare Amplicon Libraries Offen

feature request priority:low training wontfix

biocore/LabControl#289 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Verify correct display of blanks in quantitation heatmap and add legend explaining Offen

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#292 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Determine how wet lab models inputs for amplicon pool library plates and decide on interface changes to address Offen

enhancement front-end scope:medium scope:small

biocore/LabControl#293 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Update labeling on Prepare Amplicon Sequencing Pool page Offen

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#294 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Allow filtering by plate type in all plate selection steps Offen

feature request priority:high scope:medium

biocore/LabControl#297 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Add labeling on PicoGreen Quantification page indicating expected format for files to be uploaded Offen

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#298 · 4 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Clarify save status of sample plating in interface Offen

enhancement front-end priority:low scope:small

biocore/LabControl#302 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Clarify meaning or change iconography for red "remove plate" Xs in interface Offen

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#304 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Explicitly indicate which plates go in which quadrant during gDNA compression Offen

feature request front-end priority:high scope:medium

biocore/LabControl#305 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Reposition or clarify location of Download buttons in interface Offen

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#306 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Clarify labeling of volume field on Prepare Shotgun Libraries page Offen

enhancement front-end priority:high scope:small

biocore/LabControl#308 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
Remove or otherwise deprecate "destination tube" field on Pool Library Plates page Offen

feature request priority:high scope:small

biocore/LabControl#310 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Relabel and provide convention guidance for "Run Name" and "Run Experiment" on Prepare Sequencing Run page Offen

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#311 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Clarify in interface how to re-view existing quantitations Offen

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#312 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Allow lab to pick which lane a pool goes into on Prepare Sequencing Run page Offen

feature request priority:high scope:small

biocore/LabControl#313 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Improve labeling, activation for well comments in Plate Samples Offen

enhancement feature request front-end priority:high scope:small

biocore/LabControl#314 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Fix "reformat" option in Normalize gDNA Plates Offen

bug priority:high scope:small

biocore/LabControl#323 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Extend Preparation Info file to have an Ext_robot_EP column and an Ext_robot_KF column instead of a single Extraction_robot column Offen

feature request priority:high scope:small

biocore/LabControl#324 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Capture sequencing run prep information and insert into prep file Offen

feature request scope:large

biocore/LabControl#333 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Improve GUI display of unexpected errors Offen

enhancement priority:low scope:medium

biocore/LabControl#338 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Determine correct volume for wells in new gDNA compression plate Offen

code refactor priority:medium scope:small

biocore/LabControl#341 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Support generating prep info files for non-Illumina sequencing runs Offen

feature request scope:large

biocore/LabControl#342 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Warn user if prep info file contains duplicate samples Offen

feature request priority:medium scope:medium

biocore/LabControl#343 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Warn if number of physical samples doesn't match number of samples with metadata Offen

feature request priority:low scope:large

biocore/LabControl#344 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Change labman.well table to store row_num and col_num as zero-based Offen

code refactor scope:medium

biocore/LabControl#345 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Configuration manager defaults point to non-existent folder Offen

bug priority:high scope:small

biocore/LabControl#347 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
Prevent silent timeout failure when computing pool values on "Pool library plates" page Offen

bug priority:high scope:unknown

biocore/LabControl#361 · 5 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
Allow viewing of pooling settings for an existing pool made from "Pool library plates" OR "Prepare amplicon sequencing pool" Offen

feature request priority:high scope:large

biocore/LabControl#362 · 4 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
Require run names to be unique or display create time Offen

feature request priority:high scope:small

biocore/LabControl#365 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026

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