biocore/LabControl

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lab manager for plate maps and sequence flows

Estrellas: 2
Forks: 15
Issues abiertos para principiantes: 0
Issues indexados: 123

Lenguaje dominante: Python
Licencia: BSD-3-Clause
Último push a GitHub: 12/9/2019
Última indexación: 14/9/2026
Guía de contribución: Sin guía de contribución
Código de conducta: Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes: Sin etiquetas para principiantes indexadas
Métricas de merge de PR: Sin PR fusionados en 30 d

Abierto Todos

123 issues abiertos indexados

Add parameter to track number of times a lot, primer plate, etc is used and a way to warn if too many uses Abierto

feature request scope:large

biocore/LabControl#31 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Highlight cells per study Abierto

feature request scope:medium

biocore/LabControl#52 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Implement repooling functionality Abierto

feature request scope:large

biocore/LabControl#53 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Create an interface that, given a plate, provides its ancestry and descendency Abierto

feature request priority:medium scope:large

biocore/LabControl#77 · 11 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Refactor backend to rename 16S to amplicon Abierto

code refactor scope:medium

biocore/LabControl#91 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Add comment box in gDNA plate extraction Abierto

feature request scope:medium

biocore/LabControl#128 · 3 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Implement unit tests for javascript functionality Abierto

code refactor priority:high scope:large

biocore/LabControl#171 · 4 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
Stress test the software Abierto

enhancement priority:high scope:large

biocore/LabControl#173 · 7 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Idea: Is there any way to integrate a biosafetly level warning button that goes away once the samples are extracted? Abierto

feature request scope:unknown

biocore/LabControl#179 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
export all plate maps from a single study to a tsv/excel file Abierto

feature request scope:unknown

biocore/LabControl#190 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Ensure that data duplication by "contents" field in sample_composition is acceptable Abierto

code refactor priority:high scope:large

biocore/LabControl#220 · 3 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Add ENV_package to sample sheet Abierto

feature request priority:high scope:medium

biocore/LabControl#227 · 22 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Make a more generalized 'upstream' connector in composition objects/tables? Abierto

code refactor scope:large

biocore/LabControl#234 · 11 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Change sample sheet Sample_ID and Sample_Name to use actual sample id instead of sample "content"? Abierto

enhancement scope:small wontfix

biocore/LabControl#237 · 5 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Add comments to multiple wells based on selection Abierto

feature request scope:large

biocore/LabControl#244 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Add tooltips to pooling interface to explain parameter values Abierto

feature request front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#249 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
for gDNA plate compression, add diagram to output Abierto

feature request scope:medium

biocore/LabControl#252 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Prevent creation of sequencing runs without all lanes filled Abierto

feature request scope:small wontfix

biocore/LabControl#261 · 3 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Consolidate "components" attribute logic in PoolingProcess and PoolComposition Abierto

code refactor priority:low scope:small

biocore/LabControl#265 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Move definition of number of lanes per sequencer into database from SequencingProcess Abierto

code refactor priority:low scope:medium

biocore/LabControl#266 · 6 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
View, modify, and search well contents of multiple plates at same time during sample plating Abierto

feature request priority:medium scope:large

biocore/LabControl#285 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Add Primer Date selection in Prepare Amplicon Libraries Abierto

feature request priority:low training wontfix

biocore/LabControl#289 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Verify correct display of blanks in quantitation heatmap and add legend explaining Abierto

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#292 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Determine how wet lab models inputs for amplicon pool library plates and decide on interface changes to address Abierto

enhancement front-end scope:medium scope:small

biocore/LabControl#293 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Update labeling on Prepare Amplicon Sequencing Pool page Abierto

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#294 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Allow filtering by plate type in all plate selection steps Abierto

feature request priority:high scope:medium

biocore/LabControl#297 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Add labeling on PicoGreen Quantification page indicating expected format for files to be uploaded Abierto

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#298 · 4 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Clarify save status of sample plating in interface Abierto

enhancement front-end priority:low scope:small

biocore/LabControl#302 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Clarify meaning or change iconography for red "remove plate" Xs in interface Abierto

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#304 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Explicitly indicate which plates go in which quadrant during gDNA compression Abierto

feature request front-end priority:high scope:medium

biocore/LabControl#305 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Reposition or clarify location of Download buttons in interface Abierto

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#306 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Clarify labeling of volume field on Prepare Shotgun Libraries page Abierto

enhancement front-end priority:high scope:small

biocore/LabControl#308 · 2 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
Remove or otherwise deprecate "destination tube" field on Pool Library Plates page Abierto

feature request priority:high scope:small

biocore/LabControl#310 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Relabel and provide convention guidance for "Run Name" and "Run Experiment" on Prepare Sequencing Run page Abierto

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#311 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Clarify in interface how to re-view existing quantitations Abierto

enhancement front-end priority:medium scope:small

biocore/LabControl#312 · 3 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Allow lab to pick which lane a pool goes into on Prepare Sequencing Run page Abierto

feature request priority:high scope:small

biocore/LabControl#313 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Improve labeling, activation for well comments in Plate Samples Abierto

enhancement feature request front-end priority:high scope:small

biocore/LabControl#314 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Fix "reformat" option in Normalize gDNA Plates Abierto

bug priority:high scope:small

biocore/LabControl#323 · 3 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Extend Preparation Info file to have an Ext_robot_EP column and an Ext_robot_KF column instead of a single Extraction_robot column Abierto

feature request priority:high scope:small

biocore/LabControl#324 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Capture sequencing run prep information and insert into prep file Abierto

feature request scope:large

biocore/LabControl#333 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Improve GUI display of unexpected errors Abierto

enhancement priority:low scope:medium

biocore/LabControl#338 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Determine correct volume for wells in new gDNA compression plate Abierto

code refactor priority:medium scope:small

biocore/LabControl#341 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Support generating prep info files for non-Illumina sequencing runs Abierto

feature request scope:large

biocore/LabControl#342 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Warn user if prep info file contains duplicate samples Abierto

feature request priority:medium scope:medium

biocore/LabControl#343 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Warn if number of physical samples doesn't match number of samples with metadata Abierto

feature request priority:low scope:large

biocore/LabControl#344 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Change labman.well table to store row_num and col_num as zero-based Abierto

code refactor scope:medium

biocore/LabControl#345 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Configuration manager defaults point to non-existent folder Abierto

bug priority:high scope:small

biocore/LabControl#347 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026
Prevent silent timeout failure when computing pool values on "Pool library plates" page Abierto

bug priority:high scope:unknown

biocore/LabControl#361 · 5 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
Allow viewing of pooling settings for an existing pool made from "Pool library plates" OR "Prepare amplicon sequencing pool" Abierto

feature request priority:high scope:large

biocore/LabControl#362 · 4 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 14/9/2026
Require run names to be unique or display create time Abierto

feature request priority:high scope:small

biocore/LabControl#365 · 3 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 14/9/2026

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