Support generating prep info files for non-Illumina sequencing runs
Dieses Issue hat noch niemand übernommen.
- Vorherrschende Sprache
- Python
- Sterne
- 2
- Forks
- 15
- PR-Merge-Kennzahlen
- Keine gemergten PRs in 30 T.
Beschreibung
Generated from https://github.com/jdereus/labman/pull/328#discussion_r213092518 and https://github.com/jdereus/labman/pull/328#discussion_r213091133 .
If we DO need to make some decisions by sequencing technology, we will need to store that info in the labman database, and it is not there right now--for example, the "description" field that was previously referenced holds the human-readable NAME of the equipment type being used ("MiSeq", "HiSeq3000", etc) not the sequencing technology.
Beitragsleitfaden
Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert
Erste Schritte
- Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
- Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
- Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
Rechercherichtung
Beginne mit der Durchsicht der Diskussionen im verknüpften Pull Request #328 und untersuche, wie Gerätetypen in der LabControl-Datenbank dargestellt werden. Ermittle, welche Informationen zur Sequenzierungstechnologie für nicht-Illumina-Läufe benötigt werden und wie sich die Dateien mit den Prep-Informationen unterscheiden sollten. Als abgeschlossen gilt die Aufgabe, wenn ein abgestimmtes Datenmodell und ein definiertes Generierungsverhalten vorliegen.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Bewertung
- Tech-Stack
- python
- Bereich
- backend, databases
- Issue-Typ
- Feature
- Schwierigkeit
- 5/5
- Geschätzter Aufwand
- Über eine Woche
- Aktivitätsstatus
- Veraltet
- Klarheit
- Muss geklärt werden
- Anfängerfreundlichkeit
- 20/100