Project-MONAI / Project-MONAI/tutorials
Data preparation for MAISI tutorial is wrong for non-RAS data
Chưa có ai nhận issue này.
- Ngôn ngữ chính
- Jupyter Notebook
- Star
- 2.5k
- Fork
- 803
- Merge trung bình
- 6 ngày 22 giờ
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 3
Mô tả
In the data preparation, the plain_transforms uses monai.transforms.Orientationd(keys="image", axcodes="RAS"), to reorient the image, but the new dimension is set using plain_transforms({"image": os.path.join(args.data_base_dir, filepath)})["image"].meta["dim"][_i] which has the original dimension, not the new dimension.
Hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu tại generation/maisi/scripts/diff_model_create_training_data.py, khoảng dòng 199, và kiểm tra cách plain_transforms định hướng lại các ảnh không phải RAS trước khi kích thước được ghi nhận. Xác minh rằng kích thước được sử dụng để chuẩn bị dữ liệu huấn luyện phản ánh ảnh đã được định hướng lại, sau đó chạy các bước kiểm tra chuẩn bị dữ liệu có sẵn trong tutorial để xác nhận rằng các đầu vào không phải RAS tạo ra kích thước chính xác.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Đánh giá
- Công nghệ
- python
- Lĩnh vực
- machine-learning
- Loại issue
- Lỗi
- Độ khó
- 3/5
- Thời gian dự kiến
- 1-2 ngày
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Độ rõ ràng
- Đặc tả rõ ràng
- Mức phù hợp với người mới
- 55/100