Accessing a file in a subfolder on PhysioNet using pn_dir
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描述
I'm using wfdb 4.1.2, and when I try to run this code it fails with a 404:
import wfdb
record = wfdb.rdrecord('p1003/p10030753/s40735970/40735970', pn_dir='mimic-iv-ecg')
NetFileNotFoundError: 404 Error: Not Found for url: https://physionet.org/files/mimic-iv-ecg/1.0/40735970.hea
Looks like this relates to hacky path parsing which there is an open (semi-complete) PR for (#346).
I also tried:
import wfdb
record = wfdb.rdrecord('40735970', pn_dir='mimic-iv-ecg/1.0/p1003/p10030753/s40735970')
NetFileNotFoundError: 404 Error: Not Found for url: https://physionet.org/files/mimic-iv-ecg/1.0/p1003/p10030753/s40735970/40735970.hea
So I played with the path, and this ends up working:
import wfdb
record = wfdb.rdrecord('40735970', pn_dir='mimic-iv-ecg/1.0/files/p1003/p10030753/s40735970')
Seems a bit unintuitive to me that you have to put files in there, am I doing something wrong?
贡献指南
这个仓库没有索引到贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue,再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库,在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request,并在描述里引用这个 Issue 编号。
调研方向
从 wfdb.rdrecord 开始,跟踪 PhysioNet 下载中 record 和 pn_dir 的组合方式。重现两个失败示例,然后阅读尚未完成的 PR #346,了解现有的路径解析方法。完成的标准是:嵌套的 MIMIC-IV-ECG 记录无需要求一个不直观的 files 段即可解析,并且为所示路径提供回归覆盖。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
评估
- 技术栈
- python
- 领域
- backend
- Issue 类型
- 缺陷
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 活跃度
- 停滞
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 新手友好度
- 35/100