annotation.py:get_contained_labels (1335): pandas throws TypeError: Passing a set as an indexer is not supported. Use a list instead.

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Avaliação

Dificuldade
2/5
Tempo estimado
1-3 horas
Facilidade para iniciantes
45/100
Tipo de issue
Bug
Clareza
Claramente especificada
Status de atividade
Estagnada
Stack de tecnologia
pandas, python
Domínio
data

Direção de pesquisa

Comece em annotation.py, em get_contained_labels, especialmente na indexação ao redor das linhas 1335-1355, e inspecione outras ocorrências de indexação de label_map baseada em conjuntos. Verifique o caminho de acesso à anotação afetado com pandas 2.1.3 ou posterior; está concluído quando ele não gerar mais o TypeError do indexador de conjuntos.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Descrição

Using python version of libwfdb 4.1.2 which is according to pypi the latest.

Since lately when accessing the annotations i do get the error

TypeError: Passing a set as an indexer is not supported. Use a list instead.

This is caused by passing the following indexing tuple in line

index_vals = {1, 5}
# annotation.py(1355)get_contained_labels
contained_labels = label_map.loc[index_vals, :]

for now i do fix this by replacing the above line by

contained_labels = label_map.loc[list(index_vals), :]

and any further occurence.

The reason is that pandas has droped support for settype index arround version 2.1.3 which i do have currently installed.

Linguagem predominante
Jupyter Notebook
Estrelas
853
Forks
322
Nenhum PR com merge em 30d

Guia de contribuição

Nenhum guia de contribuição indexado para este repositório

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

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