annotation.py:get_contained_labels (1335): pandas throws TypeError: Passing a set as an indexer is not supported. Use a list instead.

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Évaluation

Difficulté
2/5
Temps estimé
1-3 heures
Accessibilité débutants
45/100
Type d'issue
Bug
Clarté
Clairement spécifiée
Activité
À l'abandon
Stack technique
pandas, python
Domaine
data

Piste de recherche

Commencez dans annotation.py, au niveau de get_contained_labels, en particulier autour de l’indexation des lignes 1335-1355, et examinez les autres occurrences d’indexation de label_map basée sur un ensemble. Vérifiez le chemin d’accès aux annotations concerné avec pandas 2.1.3 ou une version ultérieure ; c’est terminé lorsqu’il ne lève plus le TypeError de l’indexeur d’ensemble.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

Using python version of libwfdb 4.1.2 which is according to pypi the latest.

Since lately when accessing the annotations i do get the error

TypeError: Passing a set as an indexer is not supported. Use a list instead.

This is caused by passing the following indexing tuple in line

index_vals = {1, 5}
# annotation.py(1355)get_contained_labels
contained_labels = label_map.loc[index_vals, :]

for now i do fix this by replacing the above line by

contained_labels = label_map.loc[list(index_vals), :]

and any further occurence.

The reason is that pandas has droped support for settype index arround version 2.1.3 which i do have currently installed.

Langage dominant
Jupyter Notebook
Étoiles
853
Forks
322
Aucune PR mergée en 30 j

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