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Bug report: Incorrect drawing order of Isosurfaces with opacity

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bug P2
Langage dominant
Python
Étoiles
18.8k
Forks
2.8k
Merge moyen
16 h 26 min
PR mergées (30 j)
21

Description

  • Reported by Łukasz as a post on the forum
  • Plotly version: 6.2.0
  • Python version: 3.11.13
  • Browser: chrome

Hi, i have found quite annoying bug which can be seen only when the isosurface components are opaque. I observed that it doesn’t only occur for multiple trace isosurfaces, but also single multisurface isosurfaces and volume plots.

Here is an example code how to replicate it:
(The fun part is that when you change the opacity from 0.99 to 1 the plot gets visualised properly.)

import plotly.graph_objects as go
import numpy as np
import nrrd
from skimage.transform import resize


volume = np.zeros((50, 50, 50))
volume[1:10, 5:45, 5:45] =1
volume[10:20, 5:45, 5:45] = 1.5
volume[20:30, 5:45, 5:45] = 2
volume[30:40, 5:45, 5:45] = 2.5
volume[40:49, 5:45, 5:45] = 3
Z, X, Y = np.mgrid[0:volume.shape[0]:1, 0:volume.shape[1]:1, 0:volume.shape[2]:1]


fig = go.Figure(data=[go.Isosurface(
    x=X.flatten(),
    y=Y.flatten(),
    z=Z.flatten(),
    opacity=0.99,
    value=np.where(volume == 1, 1, 0).flatten(),
    surface_fill=1,
    surface_count=1,
    colorscale=[[0, 'rgb(0,255,0)'], [1, 'rgb(0,255,0)']],
    caps=dict(x_show=False, y_show=False, z_show=False),
    #slices_z=dict(show=True, locations=list(range(volume.shape[0]))),
    ),
    go.Isosurface(
        x=X.flatten(),
        y=Y.flatten(),
        z=Z.flatten(),
        opacity=0.99,
        value=np.where(volume == 3, 1, 0).flatten(),
        surface_fill=1,
        surface_count=1,
        colorscale=[[0, 'rgb(255,0,0)'], [1, 'rgb(255,0,0)']],
        caps=dict(x_show=False, y_show=False, z_show=False),
        # slices_z=dict(show=True, locations=list(range(volume.shape[0]))),
    )])

The bug can be seen looking form under the plot:

Guide de contribution

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Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

Piste de recherche

Commencez par exécuter la reproduction Python fournie dans Chrome et comparez isosurface et volume rendering avec une opacité de 0.99 par rapport à 1. Étudiez le chemin de rendu pour les Isosurfaces, multisurfaces et volume plots opaques et presque opaques. Le travail est terminé lorsque les cas fournis sont dessinés dans le bon ordre sans entraîner de régression du rendu complètement opaque.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
python
Domaine
data-visualization
Type d'issue
Bug
Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Activité
À l'abandon
Clarté
Plutôt claire
Accessibilité débutants
38/100

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