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Unrenderable violin plot

Aberta
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bug P2
Linguagem predominante
Python
Estrelas
18.8k
Forks
2.8k
Merge médio
16h 26min
PRs com merge (30d)
21

Descrição

I have some example input here and a script for creating a violin plot. The plot writes without error but appears unrenderable, it never displays and will e.g., cause notebooks to crash.

Python 3.13.5
plotly 6.0.1
pandas 2.2.3
import pandas as pd
import plotly.express as px
from plotly.graph_objects import Figure


def create_plot(df: pd.DataFrame) -> Figure:
    fig = px.violin(
        df,
        color='sample',
        color_discrete_sequence=px.colors.qualitative.Safe,
        y='value',
        x='sample',
        points=False,
        box=True,
        facet_col='metric',
        facet_col_wrap=1,
    )
    fig.update_yaxes(matches=None)
    fig.update_xaxes(matches=None)
    fig.update_layout(height=400 * len(df['metric'].unique()))
    return fig


if __name__ == '__main__':
    file = 'df_melted.csv'
    df = pd.read_csv(file)
    fig = create_plot(df)
    fig.write_html('test_plot.html')

Example input file is attached. The input is admittedly unusual for a violin plot (essentially all 0s or all 1s).

Thanks in advance!

df_melted.csv

Guia de contribuição

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Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

Direção de pesquisa

Comece executando o script Python fornecido com o df_melted.csv anexado no Python 3.13.5; em seguida, inspecione test_plot.html e reproduza a falha do notebook. Rastreie o caminho de renderização do gráfico de violino para essa entrada; considera-se concluído quando o HTML gerado é renderizado e a mesma figura não causa mais falhas nos notebooks.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Avaliação

Stack de tecnologia
pandas, plotly, python
Domínio
data-visualization
Tipo de issue
Bug
Dificuldade
3/5
Tempo estimado
1-2 dias
Status de atividade
Estagnada
Clareza
Razoavelmente clara
Facilidade para iniciantes
52/100

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