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Unrenderable violin plot

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bug P2
Lenguaje dominante
Python
Estrellas
18.8k
Forks
2.8k
Merge medio
16 h 26 min
PR fusionados (30 d)
21

Descripción

I have some example input here and a script for creating a violin plot. The plot writes without error but appears unrenderable, it never displays and will e.g., cause notebooks to crash.

Python 3.13.5
plotly 6.0.1
pandas 2.2.3
import pandas as pd
import plotly.express as px
from plotly.graph_objects import Figure


def create_plot(df: pd.DataFrame) -> Figure:
    fig = px.violin(
        df,
        color='sample',
        color_discrete_sequence=px.colors.qualitative.Safe,
        y='value',
        x='sample',
        points=False,
        box=True,
        facet_col='metric',
        facet_col_wrap=1,
    )
    fig.update_yaxes(matches=None)
    fig.update_xaxes(matches=None)
    fig.update_layout(height=400 * len(df['metric'].unique()))
    return fig


if __name__ == '__main__':
    file = 'df_melted.csv'
    df = pd.read_csv(file)
    fig = create_plot(df)
    fig.write_html('test_plot.html')

Example input file is attached. The input is admittedly unusual for a violin plot (essentially all 0s or all 1s).

Thanks in advance!

df_melted.csv

Guía de contribución

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Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

Línea de trabajo

Empieza ejecutando el script de Python proporcionado con el df_melted.csv adjunto en Python 3.13.5; después inspecciona test_plot.html y reproduce el fallo del notebook. Rastrea la ruta de renderizado del gráfico de violín para esta entrada; se considera terminado cuando el HTML generado se renderiza y la misma figura ya no provoca fallos en los notebooks.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Evaluación

Stack tecnológico
pandas, plotly, python
Área
data-visualization
Tipo de issue
Error
Dificultad
3/5
Tiempo estimado
1-2 días
Estado de actividad
Estancado
Claridad
Bastante claro
Aptitud para principiantes
52/100

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