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Unrenderable violin plot

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bug P2
Langage dominant
Python
Étoiles
18.8k
Forks
2.8k
Merge moyen
16 h 26 min
PR mergées (30 j)
21

Description

I have some example input here and a script for creating a violin plot. The plot writes without error but appears unrenderable, it never displays and will e.g., cause notebooks to crash.

Python 3.13.5
plotly 6.0.1
pandas 2.2.3
import pandas as pd
import plotly.express as px
from plotly.graph_objects import Figure


def create_plot(df: pd.DataFrame) -> Figure:
    fig = px.violin(
        df,
        color='sample',
        color_discrete_sequence=px.colors.qualitative.Safe,
        y='value',
        x='sample',
        points=False,
        box=True,
        facet_col='metric',
        facet_col_wrap=1,
    )
    fig.update_yaxes(matches=None)
    fig.update_xaxes(matches=None)
    fig.update_layout(height=400 * len(df['metric'].unique()))
    return fig


if __name__ == '__main__':
    file = 'df_melted.csv'
    df = pd.read_csv(file)
    fig = create_plot(df)
    fig.write_html('test_plot.html')

Example input file is attached. The input is admittedly unusual for a violin plot (essentially all 0s or all 1s).

Thanks in advance!

df_melted.csv

Guide de contribution

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Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
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Piste de recherche

Commencez par exécuter le script Python fourni avec le fichier df_melted.csv joint sous Python 3.13.5, puis inspectez test_plot.html et reproduisez le plantage du notebook. Suivez le chemin de rendu du graphique en violon pour cette entrée ; le travail est terminé lorsque le HTML généré s’affiche et que la même figure ne fait plus planter les notebooks.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
pandas, plotly, python
Domaine
data-visualization
Type d'issue
Bug
Difficulté
3/5
Temps estimé
1-2 jours
Activité
À l'abandon
Clarté
Plutôt claire
Accessibilité débutants
52/100

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