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Unrenderable violin plot

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bug P2
Lingua principale
Python
Stelle
18.8k
Fork
2.8k
Merge medio
16h 26m
PR unite (30g)
21

Descrizione

I have some example input here and a script for creating a violin plot. The plot writes without error but appears unrenderable, it never displays and will e.g., cause notebooks to crash.

Python 3.13.5
plotly 6.0.1
pandas 2.2.3
import pandas as pd
import plotly.express as px
from plotly.graph_objects import Figure


def create_plot(df: pd.DataFrame) -> Figure:
    fig = px.violin(
        df,
        color='sample',
        color_discrete_sequence=px.colors.qualitative.Safe,
        y='value',
        x='sample',
        points=False,
        box=True,
        facet_col='metric',
        facet_col_wrap=1,
    )
    fig.update_yaxes(matches=None)
    fig.update_xaxes(matches=None)
    fig.update_layout(height=400 * len(df['metric'].unique()))
    return fig


if __name__ == '__main__':
    file = 'df_melted.csv'
    df = pd.read_csv(file)
    fig = create_plot(df)
    fig.write_html('test_plot.html')

Example input file is attached. The input is admittedly unusual for a violin plot (essentially all 0s or all 1s).

Thanks in advance!

df_melted.csv

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Inizia eseguendo lo script Python fornito con il file df_melted.csv allegato su Python 3.13.5, quindi esamina test_plot.html e riproduci il crash del notebook. Traccia il percorso di rendering del grafico violin per questo input; il lavoro è completato quando l’HTML generato viene visualizzato e la stessa figura non causa più il crash dei notebook.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
pandas, plotly, python
Ambito
data-visualization
Tipo di issue
Bug
Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
52/100

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