plotly / plotly/plotly.R

Would love to see geom_GeomBracket() to be implemented in plotly

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Lingua principale
R
Stelle
2.7k
Fork
641
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

Hello,
I am a big fan of plotly because of its interactive features and unlike any other normal static plots. I usually use ggplot to visualize my data and then use a ggplotly to make my plot into a plotly interactive plot, but for boxplot with p-value bracket , plotly does not show that feature. I would really appreciated if that feature could be added to plotly as well in the future.

df <- ToothGrowth
df$dose <- as.factor(df$dose)
head(df, 3)
stat.test <- df %>%
    group_by(dose) %>%
    t_test(len ~ supp) %>%
    adjust_pvalue(method = "bonferroni") %>%
    add_significance("p.adj")
stat.test
# Create a box plot
bxp <- ggboxplot(
    df, x = "dose", y = "len", 
    color = "supp", palette = c("#00AFBB", "#E7B800")
)

# Add p-values onto the box plots
stat.test <- stat.test %>%
    add_xy_position(x = "dose", dodge = 0.8)
bxp + stat_pvalue_manual(
    stat.test,  label = "p", tip.length = 0
)

#pvalue disappear
ggplotly(bxp + stat_pvalue_manual(
+     stat.test,  label = "p", tip.length = 0
+ ))

Warning message:
In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomBracket() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Inizia dall'avviso geom2trace.default mostrato nell'esempio e verifica come ggplotly gestisce il geom_GeomBracket() fornito. Riproduci l'esempio ToothGrowth, quindi verifica che la parentesi e i valori p compaiano nel grafico interattivo senza l'avviso relativo ai geom non implementati.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
r
Ambito
data-visualization
Tipo di issue
Funzionalità
Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
25/100

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