plotly / plotly/plotly.R

Would love to see geom_GeomBracket() to be implemented in plotly

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Langage dominant
R
Étoiles
2.7k
Forks
641
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

Hello,
I am a big fan of plotly because of its interactive features and unlike any other normal static plots. I usually use ggplot to visualize my data and then use a ggplotly to make my plot into a plotly interactive plot, but for boxplot with p-value bracket , plotly does not show that feature. I would really appreciated if that feature could be added to plotly as well in the future.

df <- ToothGrowth
df$dose <- as.factor(df$dose)
head(df, 3)
stat.test <- df %>%
    group_by(dose) %>%
    t_test(len ~ supp) %>%
    adjust_pvalue(method = "bonferroni") %>%
    add_significance("p.adj")
stat.test
# Create a box plot
bxp <- ggboxplot(
    df, x = "dose", y = "len", 
    color = "supp", palette = c("#00AFBB", "#E7B800")
)

# Add p-values onto the box plots
stat.test <- stat.test %>%
    add_xy_position(x = "dose", dodge = 0.8)
bxp + stat_pvalue_manual(
    stat.test,  label = "p", tip.length = 0
)

#pvalue disappear
ggplotly(bxp + stat_pvalue_manual(
+     stat.test,  label = "p", tip.length = 0
+ ))

Warning message:
In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomBracket() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues

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Piste de recherche

Commencez par l’avertissement geom2trace.default affiché dans l’exemple et examinez la manière dont ggplotly gère le geom_GeomBracket() fourni. Reproduisez l’exemple ToothGrowth, puis vérifiez que le crochet et les valeurs p apparaissent dans le graphique interactif sans l’avertissement concernant les geoms non implémentés.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
r
Domaine
data-visualization
Type d'issue
Fonctionnalité
Difficulté
5/5
Temps estimé
Plus d'une semaine
Activité
À l'abandon
Clarté
Plutôt claire
Accessibilité débutants
25/100

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