plotly / plotly/plotly.R

Would love to see geom_GeomBracket() to be implemented in plotly

Offen
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Vorherrschende Sprache
R
Sterne
2.7k
Forks
641
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

Hello,
I am a big fan of plotly because of its interactive features and unlike any other normal static plots. I usually use ggplot to visualize my data and then use a ggplotly to make my plot into a plotly interactive plot, but for boxplot with p-value bracket , plotly does not show that feature. I would really appreciated if that feature could be added to plotly as well in the future.

df <- ToothGrowth
df$dose <- as.factor(df$dose)
head(df, 3)
stat.test <- df %>%
    group_by(dose) %>%
    t_test(len ~ supp) %>%
    adjust_pvalue(method = "bonferroni") %>%
    add_significance("p.adj")
stat.test
# Create a box plot
bxp <- ggboxplot(
    df, x = "dose", y = "len", 
    color = "supp", palette = c("#00AFBB", "#E7B800")
)

# Add p-values onto the box plots
stat.test <- stat.test %>%
    add_xy_position(x = "dose", dodge = 0.8)
bxp + stat_pvalue_manual(
    stat.test,  label = "p", tip.length = 0
)

#pvalue disappear
ggplotly(bxp + stat_pvalue_manual(
+     stat.test,  label = "p", tip.length = 0
+ ))

Warning message:
In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomBracket() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues

Beitragsleitfaden

Beitragsleitfaden öffnen

Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Beginne bei der im Beispiel angezeigten geom2trace.default-Warnung und untersuche, wie ggplotly das übergebene geom_GeomBracket() verarbeitet. Reproduziere das ToothGrowth-Beispiel und überprüfe anschließend, dass die Klammer und die p-Werte im interaktiven Plot erscheinen, ohne dass die Warnung zu nicht implementierten Geoms ausgegeben wird.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
r
Bereich
data-visualization
Issue-Typ
Feature
Schwierigkeit
5/5
Geschätzter Aufwand
Über eine Woche
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
25/100

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