Would love to see geom_GeomBracket() to be implemented in plotly
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- Lenguaje dominante
- R
- Estrellas
- 2.7k
- Forks
- 641
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Descripción
Hello,
I am a big fan of plotly because of its interactive features and unlike any other normal static plots. I usually use ggplot to visualize my data and then use a ggplotly to make my plot into a plotly interactive plot, but for boxplot with p-value bracket , plotly does not show that feature. I would really appreciated if that feature could be added to plotly as well in the future.
df <- ToothGrowth
df$dose <- as.factor(df$dose)
head(df, 3)
stat.test <- df %>%
group_by(dose) %>%
t_test(len ~ supp) %>%
adjust_pvalue(method = "bonferroni") %>%
add_significance("p.adj")
stat.test
# Create a box plot
bxp <- ggboxplot(
df, x = "dose", y = "len",
color = "supp", palette = c("#00AFBB", "#E7B800")
)
# Add p-values onto the box plots
stat.test <- stat.test %>%
add_xy_position(x = "dose", dodge = 0.8)
bxp + stat_pvalue_manual(
stat.test, label = "p", tip.length = 0
)
#pvalue disappear
ggplotly(bxp + stat_pvalue_manual(
+ stat.test, label = "p", tip.length = 0
+ ))
Warning message:
In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomBracket() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues
Guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Línea de trabajo
Comienza con la advertencia geom2trace.default mostrada en el ejemplo e inspecciona cómo ggplotly gestiona el geom_GeomBracket() proporcionado. Reproduce el ejemplo de ToothGrowth y, después, verifica que el corchete y los valores p aparezcan en el gráfico interactivo sin la advertencia de geom no implementado.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Evaluación
- Stack tecnológico
- r
- Área
- data-visualization
- Tipo de issue
- Nueva funcionalidad
- Dificultad
- 5/5
- Tiempo estimado
- Más de una semana
- Estado de actividad
- Estancado
- Claridad
- Bastante claro
- Aptitud para principiantes
- 25/100