plotly / plotly/plotly.R

Would love to see geom_GeomBracket() to be implemented in plotly

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Lenguaje dominante
R
Estrellas
2.7k
Forks
641
Métricas de merge de PR
Sin PR fusionados en 30 d

Descripción

Hello,
I am a big fan of plotly because of its interactive features and unlike any other normal static plots. I usually use ggplot to visualize my data and then use a ggplotly to make my plot into a plotly interactive plot, but for boxplot with p-value bracket , plotly does not show that feature. I would really appreciated if that feature could be added to plotly as well in the future.

df <- ToothGrowth
df$dose <- as.factor(df$dose)
head(df, 3)
stat.test <- df %>%
    group_by(dose) %>%
    t_test(len ~ supp) %>%
    adjust_pvalue(method = "bonferroni") %>%
    add_significance("p.adj")
stat.test
# Create a box plot
bxp <- ggboxplot(
    df, x = "dose", y = "len", 
    color = "supp", palette = c("#00AFBB", "#E7B800")
)

# Add p-values onto the box plots
stat.test <- stat.test %>%
    add_xy_position(x = "dose", dodge = 0.8)
bxp + stat_pvalue_manual(
    stat.test,  label = "p", tip.length = 0
)

#pvalue disappear
ggplotly(bxp + stat_pvalue_manual(
+     stat.test,  label = "p", tip.length = 0
+ ))

Warning message:
In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomBracket() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues

Guía de contribución

Abrir la guía de contribución

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

Línea de trabajo

Comienza con la advertencia geom2trace.default mostrada en el ejemplo e inspecciona cómo ggplotly gestiona el geom_GeomBracket() proporcionado. Reproduce el ejemplo de ToothGrowth y, después, verifica que el corchete y los valores p aparezcan en el gráfico interactivo sin la advertencia de geom no implementado.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Evaluación

Stack tecnológico
r
Área
data-visualization
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Estado de actividad
Estancado
Claridad
Bastante claro
Aptitud para principiantes
25/100

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