matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib

Line Plot Widget for sequential data

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New feature
主要言語
Python
スター
46
フォーク
24
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

説明

Hi @dstansby , hi all,

I currently have a couple local implementations of a plotter with line plots based on metadata.
Data are stored in metadata because sometimes I generate data from intensity images which in napari, as far as I know, do not have 'properties' or 'features'.
I would like to have a general line plotter to import from. Thus, I naturally thought about napari-matplotlib!

To encompass all layer types, including the Image layer, I thought about storing the plotting data as a nested dictionary in the layer metadata, somtehing like:

{'plugin_name': 
    {'x_data': array},
    {'y_data': array},
    {'other_data': array} }`

I have some code that works with that kind of structure. Would that be an interesting contribution here?
From a plugin developer's perspective, storing data as a two level dictionary would allow filtering data origin (by 'plugin_name', so different plugins could fit) apart from regular image metadata and then axes would come from the internal keys. @kevinyamauchi , do you think such structure would be interesting?

Here is an example:
Capture

For example, for plotting a time series, a developer could include a time dimension array there as well.

If this should not belong here, that's also OK, I could place it somewhere else, just let me know ;)
I can make a Draft PR to further discuss this.

Best,
Marcelo

コントリビューションガイド

このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

調査の方向性

ファイル、テスト、エントリポイントは特定されていません。まず、提案されているメタデータ構造とウィジェットのスコープについてメンテナーと確認してください。完了の定義は、関連する napari のレイヤー型全体でシーケンシャルデータをプロットするための実装計画について合意できていることです。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

評価

技術スタック
python
領域
data-visualization
issue の種類
機能追加
難易度
5/5
見積もり時間
1週間以上
活発さ
停滞
明瞭さ
説明が足りない
初心者へのやさしさ
25/100

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