matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib

Measure along / within ROIs

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New feature
主要语言
Python
星标
46
派生
24
PR 合并指标
30 天内没有已合并 PR

描述

Not sure if this is within the scope of the project, but it would be nice to be able to measure along ROIs (e.g. a "profile line" through that moves through space in one (more, eventually?) axis. Through lines, it could be a profile line. With polygons, it could be average intensity (or any other function that takes a set of pixels and returns a number), or a profile line along the circumference of the shape.

Something like this as an example of the profile line:
image

I worked on something like this a couple of years ago, and might give it a shot when I have the time, but I thought I'd leave this here so I could remember, and if it inspired anyone else to give it a shot since I think it'd be very useful!

贡献指南

这个仓库没有索引到贡献指南

从这里开始

  1. 先读完整个 Issue,再读项目的贡献指南。
  2. 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
  3. Fork 仓库,在一个分支上完成修改。
  4. 提交 Pull Request,并在描述里引用这个 Issue 编号。

调研方向

issue 中没有指定文件、测试或入口点。首先检查仓库中现有的 ROI 和 plotting 入口点,然后明确线剖面、多边形聚合和周长剖面是否在范围内。只有明确规定了受支持的 ROI 测量及其预期行为,才能视为完成。

由索引模型根据 Issue 内容生成。

评估

技术栈
matplotlib, python
领域
data-visualization
Issue 类型
功能
难度
5/5
预计耗时
一周以上
活跃度
停滞
描述清晰度
需要澄清
新手友好度
25/100

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