matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib

Measure along / within ROIs

Offen
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New feature
Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
46
Forks
24
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

Not sure if this is within the scope of the project, but it would be nice to be able to measure along ROIs (e.g. a "profile line" through that moves through space in one (more, eventually?) axis. Through lines, it could be a profile line. With polygons, it could be average intensity (or any other function that takes a set of pixels and returns a number), or a profile line along the circumference of the shape.

Something like this as an example of the profile line:
image

I worked on something like this a couple of years ago, and might give it a shot when I have the time, but I thought I'd leave this here so I could remember, and if it inspired anyone else to give it a shot since I think it'd be very useful!

Beitragsleitfaden

Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert

Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

In der Issue wird keine Datei, kein Test und kein Einstiegspunkt genannt. Beginne damit, die vorhandenen ROI- und Plotting-Einstiegspunkte des Repositorys zu überprüfen, und kläre anschließend, ob Linienprofile, Polygonaggregation und Umfangsprofile im Umfang enthalten sind. Als erledigt gilt die Aufgabe, wenn die unterstützten ROI-Messungen und ihr erwartetes Verhalten ausdrücklich definiert sind.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
matplotlib, python
Bereich
data-visualization
Issue-Typ
Feature
Schwierigkeit
5/5
Geschätzter Aufwand
Über eine Woche
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Muss geklärt werden
Anfängerfreundlichkeit
25/100

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