matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib

Measure along / within ROIs

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New feature
Lenguaje dominante
Python
Estrellas
46
Forks
24
Métricas de merge de PR
Sin PR fusionados en 30 d

Descripción

Not sure if this is within the scope of the project, but it would be nice to be able to measure along ROIs (e.g. a "profile line" through that moves through space in one (more, eventually?) axis. Through lines, it could be a profile line. With polygons, it could be average intensity (or any other function that takes a set of pixels and returns a number), or a profile line along the circumference of the shape.

Something like this as an example of the profile line:
image

I worked on something like this a couple of years ago, and might give it a shot when I have the time, but I thought I'd leave this here so I could remember, and if it inspired anyone else to give it a shot since I think it'd be very useful!

Guía de contribución

No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

Línea de trabajo

En el issue no se menciona ningún archivo, prueba ni punto de entrada. Empieza revisando los puntos de entrada existentes del repositorio para ROI y plotting, y después aclara si los perfiles de línea, la agregación de polígonos y los perfiles de circunferencia están incluidos en el alcance. La tarea debe considerarse terminada cuando las mediciones de ROI compatibles y su comportamiento esperado estén definidos explícitamente.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Evaluación

Stack tecnológico
matplotlib, python
Área
data-visualization
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Estado de actividad
Estancado
Claridad
Necesita aclaración
Aptitud para principiantes
25/100

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