matplotlib / matplotlib/napari-matplotlib

Measure along / within ROIs

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New feature
Lingua principale
Python
Stelle
46
Fork
24
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

Not sure if this is within the scope of the project, but it would be nice to be able to measure along ROIs (e.g. a "profile line" through that moves through space in one (more, eventually?) axis. Through lines, it could be a profile line. With polygons, it could be average intensity (or any other function that takes a set of pixels and returns a number), or a profile line along the circumference of the shape.

Something like this as an example of the profile line:
image

I worked on something like this a couple of years ago, and might give it a shot when I have the time, but I thought I'd leave this here so I could remember, and if it inspired anyone else to give it a shot since I think it'd be very useful!

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Nell'issue non sono indicati file, test o entry point. Inizia esaminando gli entry point esistenti del repository per ROI e plotting, quindi chiarisci se i profili di linea, l'aggregazione dei poligoni e i profili della circonferenza rientrano nell'ambito. L'attività deve considerarsi completata quando le misurazioni ROI supportate e il loro comportamento previsto sono definiti esplicitamente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
matplotlib, python
Ambito
data-visualization
Tipo di issue
Funzionalità
Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Da chiarire
Idoneità per principianti
25/100

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