possble DelayedArray constructor over `IntegerList` (or other `List`)
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評価
調査の方向性
DelayedArray コンストラクターから始め、issue の IntegerList の例を再現し、DelayedArray(array(XX)) と比較します。List を直接サポートするために必要な範囲を判断し、スライシングによって通常のリストではなく IntegerList が返されることを確認します。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Hi @hpages ,
In the VariantAnnotation package, the CollapsedVCF (or ExpandedVCF) are saving the data entries in IntegerList / CharacterList.... And in the development of VCFArray, we are trying to represent these data entries as DelayedArray instances. Now we are converting the data entries into array to add dimension, and then use the DelayedArray constructor over the array. Is it possible to have the DelayedArray constructor directly work on List object? so that the internal data saving are still using a more efficient way in List structure than the ordinary list? @mtmorgan
> XX <- IntegerList(c(list(rep(NA, 2)), list(rep(NA, 2)), list(rep(NA, 2)), list(rep(NA, 2))))
> XX
IntegerList of length 4
[[1]] <NA> <NA>
[[2]] <NA> <NA>
[[3]] <NA> <NA>
[[4]] <NA> <NA>
> DelayedArray(array(XX))
<4> DelayedArray object of type "list": ## the type is ordinary list.
[1] [2] [3] [4]
NA, NA NA, NA NA, NA NA, NA
!> DelayedArray(array(XX))[1:2]
[[1]]
[1] NA NA
[[2]]
[1] NA NA
## What we want is something like:
!> DelayedArray(XX)
<4> DelayedArray object of type "IntegerList":
[1] [2] [3] [4]
NA, NA NA, NA NA, NA NA, NA
!> DelayedArray(XX)[1:2]
IntegerList of length 2
[[1]] <NA> <NA>
[[2]] <NA> <NA>
- 主要言語
- R
- スター
- 29
- フォーク
- 12
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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