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Bioconductor

索引済みのリポジトリ 84 件 · GitHub で見る

• Contributions

  Contribute Packages to Bioconductor

  スター 149 個

• BiocStickers

  Stickers for some Bioconductor packages - feel free to contribute and/or modify.

  R · スター 137 個

• bioconductor_docker

  Docker Containers for Bioconductor

  Dockerfile · スター 92 個

• GenomicDataCommons

  Provide R access to the NCI Genomic Data Commons portal.

  R · スター 91 個

• BiocManager

  CRAN Package For Managing Bioconductor Packages

  R · スター 76 個

• Biostrings

  Efficient manipulation of biological strings

  R · スター 70 個

• BiocParallel

  Bioconductor facilities for parallel evaluation

  R · スター 69 個

• bioconductor-training

  Bioconductor teaching and education committee

  HTML · スター 59 個

• GenomicRanges

  Representation and manipulation of genomic intervals

  R · スター 47 個

• bioconductor.org

  Source code for the Bioconductor website

  HTML · スター 41 個

• SummarizedExperiment

  A container (S4 class) for matrix-like assays

  R · スター 39 個

• GenomeInfoDb

  Utilities for manipulating chromosome names, including modifying them to follow a particular naming style

  R · スター 36 個

• VariantAnnotation

  Annotation of Genetic Variants

  R · スター 32 個

• Rsamtools

  Binary alignment (BAM), FASTA, variant call (BCF), and tabix file import

  R · スター 31 個

• DelayedArray

  A unified framework for working transparently with on-disk and in-memory array-like datasets

  R · スター 29 個

• GenomicFeatures

  Query the gene models of a given organism/assembly

  R · スター 26 個

• IRanges

  Foundation of integer range manipulation in Bioconductor

  R · スター 24 個

• BuildABiocWorkshop

  Template for building a bioconductor workshop package using github actions

  Dockerfile · スター 23 個

• AnnotationHub

  Client for the Bioconductor AnnotationHub web resource

  R · スター 20 個

• S4Vectors

  Foundation of vector-like and list-like containers in Bioconductor

  R · スター 18 個

• ほか 64 件のリポジトリは GitHub で見る にあります