github / github/catalyst

scaled or arcsinh-transformed expression for annotation?

Đang mở
#327 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
Ngôn ngữ chính
TypeScript
Star
1.4k
Fork
59
Merge trung bình
22 giờ 12 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
5

Mô tả

Thank you for developing this excellent tool.

In the manuscript, it suggested to use the heatmap from Figure 6 to annotate clusters, but we have a question regarding the use of scaled expression values (0-1). Since this scaling can artificially inflate low-expression markers, would using arcsinh-transformed values be a more appropriate method for cluster annotation?

Hướng dẫn đóng góp

Mở hướng dẫn đóng góp

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.