github / github/catalyst

scaled or arcsinh-transformed expression for annotation?

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Langage dominant
TypeScript
Étoiles
1.4k
Forks
59
Merge moyen
22 h 12 min
PR mergées (30 j)
5

Description

Thank you for developing this excellent tool.

In the manuscript, it suggested to use the heatmap from Figure 6 to annotate clusters, but we have a question regarding the use of scaled expression values (0-1). Since this scaling can artificially inflate low-expression markers, would using arcsinh-transformed values be a more appropriate method for cluster annotation?

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