Check reproducibility of Steinbock and NanoString notebooks on Windows
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Evaluación
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Aptitud para principiantes
- 30/100
- Tipo de issue
- Error
- Claridad
- Necesita aclaración
- Estado de actividad
- Estancado
- Stack tecnológico
- jupyter-notebook
- Área
- operating-systems, testing
Línea de trabajo
Comienza ejecutando los notebooks de Steinbock y NanoString en Windows y revisa las issues enlazadas de spatialdata-io y spatialdata para comprobar el comportamiento de las rutas reportado. Compara las rutas de AnnData y las salidas de los notebooks resultantes con los resultados esperados; se considera completado cuando se confirma el problema de reproducibilidad y se identifican los pasos o las rutas afectados de los notebooks.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
As reported here for Steinbock (https://github.com/scverse/spatialdata-io/issues/129) and here for NanoString (https://github.com/scverse/spatialdata/issues/637), it looks like that / in paths (I guess inside one of the AnnData objects), create reproducibility issues on Windows machine.
- Lenguaje dominante
- Jupyter Notebook
- Estrellas
- 67
- Forks
- 26
- Merge medio
- 4 min
- PR fusionados (30 d)
- 1
Guía de contribución
No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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