Check reproducibility of Steinbock and NanoString notebooks on Windows
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 30/100
- Loại issue
- Lỗi
- Độ rõ ràng
- Cần làm rõ
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- jupyter-notebook
- Lĩnh vực
- operating-systems, testing
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu bằng cách chạy các notebook Steinbock và NanoString trên Windows, đồng thời xem xét các issue spatialdata-io và spatialdata được liên kết để kiểm tra hành vi đường dẫn đã được báo cáo. So sánh các đường dẫn AnnData và đầu ra notebook thu được với kết quả mong đợi; được xem là hoàn tất khi vấn đề về khả năng tái lập được xác nhận và các bước hoặc đường dẫn bị ảnh hưởng trong notebook được xác định.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
As reported here for Steinbock (https://github.com/scverse/spatialdata-io/issues/129) and here for NanoString (https://github.com/scverse/spatialdata/issues/637), it looks like that / in paths (I guess inside one of the AnnData objects), create reproducibility issues on Windows machine.
- Ngôn ngữ chính
- Jupyter Notebook
- Star
- 67
- Fork
- 26
- Merge trung bình
- 4 phút
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 1
Hướng dẫn đóng góp
Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của scverse/spatialdata-tutorials
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100
scverse/spatialdata-tutorials#150 · 1 bình luận ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 55/100
scverse/spatialdata-tutorials#146 · 1 reaction ·
-
Intro notebook not in docs Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
scverse/spatialdata-tutorials#137 ·
-
Update Xenium dataset Đang mở
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
scverse/spatialdata-tutorials#110 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 30/100
scverse/spatialdata-tutorials#40 · 1 bình luận ·
Tất cả issue của scverse/spatialdata-tutorials
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
-
needs: triage type: bug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
-
bug spec-mismatch
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
-
[Bug]: isStartupEntryInstalled treats access-denied as not-installed, duplicates Windows login items Đang mởclawsweeper:bulk-filed clawsweeper:no-new-fix-pr clawsweeper:source-repro impact:other issue-rating: 🦞 diamond lobster P2
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100