Check reproducibility of Steinbock and NanoString notebooks on Windows
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評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 30/100
- issue の種類
- バグ
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- jupyter-notebook
調査の方向性
まず Windows で Steinbock と NanoString のノートブックを実行し、報告されているパスの挙動について、リンクされている spatialdata-io と spatialdata の issue を確認します。得られた AnnData のパスとノートブックの出力を期待される結果と比較します。再現性の問題が確認され、影響を受けるノートブックの手順またはパスが特定されれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
As reported here for Steinbock (https://github.com/scverse/spatialdata-io/issues/129) and here for NanoString (https://github.com/scverse/spatialdata/issues/637), it looks like that / in paths (I guess inside one of the AnnData objects), create reproducibility issues on Windows machine.
- 主要言語
- Jupyter Notebook
- スター
- 67
- フォーク
- 26
- 平均マージ
- 4分
- マージ済み PR（30日）
- 1
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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