aolabNeuro/analyze

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Code for specific analysis computations on processed data (e.g. spectral coherence)

スター: 7
フォーク: 0
オープンの初心者向け issue: 0
索引済み issue: 85
平均マージ: 22時間 29分
マージ済み PR（30日）: 2

主要言語: Python
ライセンス: MIT
最終 GitHub push: 2026年8月19日
最新の索引: 2026年9月13日
コントリビューションガイド: コントリビューションガイドがありません
行動規範: 行動規範がありません
初心者向けラベル: good first issue

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オープンの issue を 85 件索引しました

optitrack metadata breaks when there are commas in any of the keys or values オープン

bug

aolabNeuro/analyze#45 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
transfer old code オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#49 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
no task in certain bmi3d experiments オープン

bug

aolabNeuro/analyze#59 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
add voltsperbit and channel ids to ecube metadata オープン

enhancement high priority

aolabNeuro/analyze#60 · コメント 4 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
add tight layout before/during savefig オープン

question

aolabNeuro/analyze#63 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
make a function to get default colors for a given number of items (channels, units maybe) オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#67 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
add kalman filter code オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#86 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 2 名 · 2026年9月13日に索引
add functions to get specific analog or digital data given a block number オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#115 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
function to center color limits on zero オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#118 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Link functions to their usage in example .ipynb notebooks オープン

documentation enhancement

aolabNeuro/analyze#139 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
add kalman filter example jupyter notebook オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#144 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
problems with postproc.get_trial_targets() オープン

invalid

aolabNeuro/analyze#165 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
visualize 3D target positions and trajectories オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#166 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Errors in test_visualization animation functions オープン

aolabNeuro/analyze#172 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
save_hdf does not announce unsaved variables failing dtype checks オープン

bug high priority

aolabNeuro/analyze#177 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Add conversion from timestamps to timeseries to preproc.prepare_bmi3d オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#186 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
add saving the xml data including voltsperbit to `aopy.utils.save_test_signal_ecube()` オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#192 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
include paramter for which ecube headstage to load オープン

question

aolabNeuro/analyze#193 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
add an option to load ecube data in volts by multiplying out the voltageperbits オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#194 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
some ecube data loading functions don't have a separate data_dir オープン

invalid

aolabNeuro/analyze#195 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
make an example notebooks showing how to call animations オープン

aolabNeuro/analyze#197 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 2 名 · 2026年9月13日に索引
exp_data['clock']['timestamp'] has repeated clock values オープン

documentation invalid

aolabNeuro/analyze#198 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Add units to BMI3D metadata オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#200 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
list aopy to pip repos/conflicting pip package name aopy オープン

aolabNeuro/analyze#204 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
butterworth filter function only works with bandpass オープン

bug high priority

aolabNeuro/analyze#208 · コメント 4 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
map_data2elec only works for 2 dim data オープン

enhancement good first issue

aolabNeuro/analyze#211 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
convert_analog_to_digital() bug? オープン

bug

aolabNeuro/analyze#229 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
get_trial_segments() generating nans? オープン

documentation

aolabNeuro/analyze#234 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
load_hdf_group incompatible with hdf datasets オープン

bug

aolabNeuro/analyze#254 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
visualization.plot_tuning_curves error if ax is not none オープン

bug

aolabNeuro/analyze#262 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
add correlation calculations オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#269 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
change inputs to multitaper_lfp_bandpower() オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#270 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
timestamps2trials オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#271 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
electrode position filtering オープン

enhancement high priority

aolabNeuro/analyze#272 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
coherence calculations オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#274 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
documentation images should be auto-generated オープン

documentation invalid

aolabNeuro/analyze#286 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
make a function to get cursor bounds for a given experiment オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#287 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
edge artifacts in lfp filtering オープン

invalid preprocessing

aolabNeuro/analyze#291 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
metadata load error in `.data.load_ecube_digital` オープン

aolabNeuro/analyze#293 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
documentation cleanup オープン

documentation

aolabNeuro/analyze#296 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
calc_max_erp() should use nanmean() instead of mean() to average across trials オープン

bug high priority

aolabNeuro/analyze#299 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
reorganize modules and add submodules オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#309 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
channel mapping grid pos オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#341 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
precondition.downsample() オープン

enhancement preprocessing

aolabNeuro/analyze#364 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
analysis.fit_linear_regression doesn't work with 1d arrays オープン

bug

aolabNeuro/analyze#377 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
trial_align_times returns different number of data points at each trial オープン

aolabNeuro/analyze#379 · コメント 5 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
cryptic error message for plot_tfr オープン

documentation

aolabNeuro/analyze#383 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
get_next_filename オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#396 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
get_implant_date() オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#397 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
load bmi3d center_out task codes function オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#412 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引

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