aolabNeuro/analyze

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Code for specific analysis computations on processed data (e.g. spectral coherence)

星标: 7
派生: 0
开放的新手 issue: 0
已索引 issue: 85
平均合并: 22 小时 29 分钟
30 天内合并 PR: 2

主要语言: Python
许可证: MIT
最近 GitHub push: 2026年8月19日
最近索引: 2026年9月13日
贡献指南: 没有贡献指南
行为准则: 没有行为准则
新手标签: good first issue

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目前已索引 85 个未关闭的 Issue

optitrack metadata breaks when there are commas in any of the keys or values 未关闭

bug

aolabNeuro/analyze#45 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
transfer old code 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#49 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
no task in certain bmi3d experiments 未关闭

bug

aolabNeuro/analyze#59 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
add voltsperbit and channel ids to ecube metadata 未关闭

enhancement high priority

aolabNeuro/analyze#60 · 4 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
add tight layout before/during savefig 未关闭

question

aolabNeuro/analyze#63 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
make a function to get default colors for a given number of items (channels, units maybe) 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#67 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
add kalman filter code 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#86 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 2 人 · 索引于 2026年9月13日
add functions to get specific analog or digital data given a block number 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#115 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
function to center color limits on zero 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#118 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Link functions to their usage in example .ipynb notebooks 未关闭

documentation enhancement

aolabNeuro/analyze#139 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
add kalman filter example jupyter notebook 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#144 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
problems with postproc.get_trial_targets() 未关闭

invalid

aolabNeuro/analyze#165 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
visualize 3D target positions and trajectories 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#166 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Errors in test_visualization animation functions 未关闭

aolabNeuro/analyze#172 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
save_hdf does not announce unsaved variables failing dtype checks 未关闭

bug high priority

aolabNeuro/analyze#177 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Add conversion from timestamps to timeseries to preproc.prepare_bmi3d 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#186 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
add saving the xml data including voltsperbit to `aopy.utils.save_test_signal_ecube()` 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#192 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
include paramter for which ecube headstage to load 未关闭

question

aolabNeuro/analyze#193 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
add an option to load ecube data in volts by multiplying out the voltageperbits 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#194 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
some ecube data loading functions don't have a separate data_dir 未关闭

invalid

aolabNeuro/analyze#195 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
make an example notebooks showing how to call animations 未关闭

aolabNeuro/analyze#197 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 2 人 · 索引于 2026年9月13日
exp_data['clock']['timestamp'] has repeated clock values 未关闭

documentation invalid

aolabNeuro/analyze#198 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Add units to BMI3D metadata 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#200 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
list aopy to pip repos/conflicting pip package name aopy 未关闭

aolabNeuro/analyze#204 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
butterworth filter function only works with bandpass 未关闭

bug high priority

aolabNeuro/analyze#208 · 4 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
map_data2elec only works for 2 dim data 未关闭

enhancement good first issue

aolabNeuro/analyze#211 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
convert_analog_to_digital() bug? 未关闭

bug

aolabNeuro/analyze#229 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
get_trial_segments() generating nans? 未关闭

documentation

aolabNeuro/analyze#234 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
load_hdf_group incompatible with hdf datasets 未关闭

bug

aolabNeuro/analyze#254 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
visualization.plot_tuning_curves error if ax is not none 未关闭

bug

aolabNeuro/analyze#262 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
add correlation calculations 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#269 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
change inputs to multitaper_lfp_bandpower() 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#270 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
timestamps2trials 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#271 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
electrode position filtering 未关闭

enhancement high priority

aolabNeuro/analyze#272 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
coherence calculations 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#274 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
documentation images should be auto-generated 未关闭

documentation invalid

aolabNeuro/analyze#286 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
make a function to get cursor bounds for a given experiment 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#287 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
edge artifacts in lfp filtering 未关闭

invalid preprocessing

aolabNeuro/analyze#291 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
metadata load error in `.data.load_ecube_digital` 未关闭

aolabNeuro/analyze#293 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
documentation cleanup 未关闭

documentation

aolabNeuro/analyze#296 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
calc_max_erp() should use nanmean() instead of mean() to average across trials 未关闭

bug high priority

aolabNeuro/analyze#299 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
reorganize modules and add submodules 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#309 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
channel mapping grid pos 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#341 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
precondition.downsample() 未关闭

enhancement preprocessing

aolabNeuro/analyze#364 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
analysis.fit_linear_regression doesn't work with 1d arrays 未关闭

bug

aolabNeuro/analyze#377 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
trial_align_times returns different number of data points at each trial 未关闭

aolabNeuro/analyze#379 · 5 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
cryptic error message for plot_tfr 未关闭

documentation

aolabNeuro/analyze#383 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
get_next_filename 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#396 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
get_implant_date() 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#397 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
load bmi3d center_out task codes function 未关闭

enhancement

aolabNeuro/analyze#412 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日

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