OpenFreeEnergy / OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks
remove fetch command
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- Lingua principale
- Jupyter Notebook
- Stelle
- 70
- Fork
- 15
- Merge medio
- 10h 42m
- PR unite (30g)
- 2
Descrizione
In the showcase notebook there's a mda.fetch_mmtf command, but fetching from rcsb can sometimes be problematic with firewalls. Better to download and include the mmtf locally in the repo.
Guida per i contributori
Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Direzione di ricerca
Apri il notebook di showcase e cerca il comando mda.fetch_mmtf. Controlla come il notebook ottiene attualmente il proprio input da RCSB, aggiungi localmente il file MMTF come richiesto e aggiorna il notebook in modo che lo utilizzi. Esegui il notebook per verificare che funzioni senza recuperare dati da RCSB.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Valutazione
- Stack tecnologico
- jupyter-notebook
- Ambito
- content, documentation
- Tipo di issue
- Refactoring
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Stato di attività
- Ferma
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Idoneità per principianti
- 38/100