OpenFreeEnergy / OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks

remove fetch command

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1.0docdrive
Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
70
Fork
15
Merge medio
10h 42m
PR unite (30g)
2

Descrizione

In the showcase notebook there's a mda.fetch_mmtf command, but fetching from rcsb can sometimes be problematic with firewalls. Better to download and include the mmtf locally in the repo.

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Apri il notebook di showcase e cerca il comando mda.fetch_mmtf. Controlla come il notebook ottiene attualmente il proprio input da RCSB, aggiungi localmente il file MMTF come richiesto e aggiorna il notebook in modo che lo utilizzi. Esegui il notebook per verificare che funzioni senza recuperare dati da RCSB.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
jupyter-notebook
Ambito
content, documentation
Tipo di issue
Refactoring
Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
38/100

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