OpenFreeEnergy / OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks

remove fetch command

Offen
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1.0docdrive
Vorherrschende Sprache
Jupyter Notebook
Sterne
70
Forks
15
Ø Merge
10 Std. 42 Min.
Gemergte PRs (30 T.)
2

Beschreibung

In the showcase notebook there's a mda.fetch_mmtf command, but fetching from rcsb can sometimes be problematic with firewalls. Better to download and include the mmtf locally in the repo.

Beitragsleitfaden

Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert

Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Öffne das Showcase-Notebook und suche den Befehl mda.fetch_mmtf. Untersuche, wie das Notebook derzeit seine RCSB-Eingabe bezieht, füge die MMTF-Datei wie angefordert lokal hinzu und aktualisiere das Notebook, damit es sie verwendet. Führe das Notebook aus, um zu bestätigen, dass es funktioniert, ohne Daten von RCSB abzurufen.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
jupyter-notebook
Bereich
content, documentation
Issue-Typ
Refactoring
Schwierigkeit
3/5
Geschätzter Aufwand
1-2 Tage
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
38/100

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