OpenFreeEnergy / OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks
remove fetch command
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- Langage dominant
- Jupyter Notebook
- Étoiles
- 70
- Forks
- 15
- Merge moyen
- 10 h 42 min
- PR mergées (30 j)
- 2
Description
In the showcase notebook there's a mda.fetch_mmtf command, but fetching from rcsb can sometimes be problematic with firewalls. Better to download and include the mmtf locally in the repo.
Guide de contribution
Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
- Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
Piste de recherche
Ouvrez le notebook de showcase et recherchez la commande mda.fetch_mmtf. Examinez la manière dont le notebook obtient actuellement son entrée RCSB, ajoutez localement le fichier MMTF comme demandé et mettez à jour le notebook pour qu’il l’utilise. Exécutez le notebook pour confirmer qu’il fonctionne sans récupérer de données depuis RCSB.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Évaluation
- Stack technique
- jupyter-notebook
- Domaine
- content, documentation
- Type d'issue
- Refactorisation
- Difficulté
- 3/5
- Temps estimé
- 1-2 jours
- Activité
- À l'abandon
- Clarté
- Plutôt claire
- Accessibilité débutants
- 38/100