annotation.py:get_contained_labels (1335): pandas throws TypeError: Passing a set as an indexer is not supported. Use a list instead.
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评估
调研方向
从 annotation.py 中的 get_contained_labels 开始，重点检查 1335-1355 行附近的索引操作，并检查其他使用基于 set 的 label_map 索引的位置。使用 pandas 2.1.3 或更高版本验证受影响的 annotation 访问路径；当不再引发 set-indexer TypeError 时即表示完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Using python version of libwfdb 4.1.2 which is according to pypi the latest.
Since lately when accessing the annotations i do get the error
TypeError: Passing a set as an indexer is not supported. Use a list instead.
This is caused by passing the following indexing tuple in line
index_vals = {1, 5}
# annotation.py(1355)get_contained_labels
contained_labels = label_map.loc[index_vals, :]
for now i do fix this by replacing the above line by
contained_labels = label_map.loc[list(index_vals), :]
and any further occurence.
The reason is that pandas has droped support for settype index arround version 2.1.3 which i do have currently installed.
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- Jupyter Notebook
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