ann2rr returns ghost beats
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- 主要言語
- Jupyter Notebook
- スター
- 853
- フォーク
- 322
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
説明
Hi,
If the input file, say `atr', contains additional labels, such as (N and (AFIB, ann2rr returns surplus rr intervals at the location of these labels.
Details:
In ann2rr in hr.py the rr intervals are calculated:
rr_interval = calc_rr(ann.sample, fs=ann.fs)
ann.sample contains the beat locations + the annotation location. Hence, ann2rr splits the rr interval which spans over each annotation location into two. This changes the heart rhythm at critical points. For example, at the beginning and end of atrial fibrillation, i.e. at (AFIB and (N.
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
調査の方向性
hr.py の ann2rr から始めます。ここでは rr_interval が calc_rr(ann.sample, fs=ann.fs) で計算されます。(N や (AFIB のようなラベルを含むアノテーションで動作を再現し、その後、追加のアノテーション位置によって余分なインターバルが生成されたり、それらの位置でリズムが変化したりしなくなっていることを確認します。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
評価
- 技術スタック
- python
- 領域
- bioinformatics
- issue の種類
- バグ
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 活発さ
- 停滞
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 初心者へのやさしさ
- 45/100