ann2rr returns ghost beats
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- Lingua principale
- Jupyter Notebook
- Stelle
- 853
- Fork
- 322
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Descrizione
Hi,
If the input file, say `atr', contains additional labels, such as (N and (AFIB, ann2rr returns surplus rr intervals at the location of these labels.
Details:
In ann2rr in hr.py the rr intervals are calculated:
rr_interval = calc_rr(ann.sample, fs=ann.fs)
ann.sample contains the beat locations + the annotation location. Hence, ann2rr splits the rr interval which spans over each annotation location into two. This changes the heart rhythm at critical points. For example, at the beginning and end of atrial fibrillation, i.e. at (AFIB and (N.
Guida per i contributori
Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Direzione di ricerca
Inizia in hr.py in ann2rr, dove rr_interval viene calcolato con calc_rr(ann.sample, fs=ann.fs). Riproduci il comportamento con annotazioni contenenti etichette come (N e (AFIB, quindi verifica che ulteriori posizioni delle annotazioni non creino più intervalli in eccesso né modifichino il ritmo in quei punti.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Valutazione
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- bioinformatics
- Tipo di issue
- Bug
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Stato di attività
- Ferma
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Idoneità per principianti
- 45/100