M1. stdio transport for the MCP server

## Why

MCP is HTTP-only today (default port `6128`). The most common MCP client integration pattern (Claude Desktop, many IDE agents, sandboxed hosts) launches servers over **stdio**. HTTP-only is a hard compatibility wall and forces port management. With adoption growing across 60+ accounts, broadening client reach is the highest-leverage agent investment.

## Proposed behavior

- `--mcp-stdio` (or `--mcp --transport stdio`) starts the server on stdio; keep HTTP as an option.
- Document both transports in `docs/mcp.md`.

## Acceptance criteria

- Server usable from a stdio MCP client end-to-end.
- HTTP behavior unchanged.
- Tests cover transport selection.
- Docs updated.

---
_Filed from the Agentic & Automation Roadmap (`docs/agentic-roadmap.md`), item **M1**, Wave 1. Priority P0._

Bắt đầu bằng cách đọc hành vi của máy chủ MCP và luồng khởi động CLI, sau đó xem xét các tùy chọn truyền tải được đề xuất trong issue. Sử dụng docs/mcp.md và bố cục test hiện có để xác định việc lựa chọn truyền tải được bao phủ ở đâu. Hoàn tất có nghĩa là stdio hoạt động end-to-end, HTTP không thay đổi, việc lựa chọn truyền tải được kiểm thử và cả hai kiểu truyền tải đều được ghi lại trong tài liệu.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.