AllenCell/allencell-segmenter-ml

Xem trên GitHub

Napari plugin for ml segmentation

Star: 5
Fork: 3
Issue cho người mới đang mở: 0
Issue đã lập chỉ mục: 171

Ngôn ngữ chính: Python
Giấy phép: Không có dữ liệu giấy phép
Lần push lên GitHub gần nhất: 22/9/2025
Lập chỉ mục gần nhất: 13/9/2026
Hướng dẫn đóng góp: Không có hướng dẫn đóng góp
Quy tắc ứng xử: Không có quy tắc ứng xử
Label cho người mới: Chưa lập chỉ mục label nào cho người mới
Chỉ số merge pull request: Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Đang mở Tất cả

Đã lập chỉ mục 171 issue đang mở

Determine remote GPU feasability Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#11 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Run napari from Ubuntu EC2 instance Đang mở

blocked

AllenCell/allencell-segmenter-ml#86 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Napari integration test Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#100 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
cyto-dl client integration tests Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#162 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Create way to download sample data from cyto-dl for users Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#170 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Enable publish workflow to edit itself to list current version Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#190 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Improve handling of napari viewer events in prediction Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#201 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Move I/O operations to worker threads Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#204 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Explore alternative solutions for channel extraction multithreading Đang mở

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#205 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Fix workflow file issues with deployment Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#210 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Refactor prediction checklist to avoid thread interrupts Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#218 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Disable structure size/image dimension inputs when continuing training Đang mở

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#221 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation UI blocks while loader initializes Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#223 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Support all types of training inputs Đang mở

wontfix

AllenCell/allencell-segmenter-ml#225 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation save csv button Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#227 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation requirement experiment name Đang mở

duplicate wontfix

AllenCell/allencell-segmenter-ml#229 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Test using pyside Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#230 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Refactor: move all module-level methods into Classes as staticmethods Đang mở

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#231 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Use cyto-dl overrides manager to generate overrides for prediction Đang mở

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#234 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Single curation mask layer Đang mở

🚨 high priority🚨 bug

AllenCell/allencell-segmenter-ml#248 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
test cyto-dl latest fixes Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#250 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Reorder the module tabs Đang mở

medium priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#255 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Update the model selection section's text Đang mở

medium priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#256 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation UI: Update Progress section Đang mở

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#261 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Enable [+Create] button for Excluding Mask Đang mở

🚨 high priority🚨 needs clarification UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#262 · 3 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation UI: set colormap & blending mode for images loaded in the viewer by the Curation UI Đang mở

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#263 · 2 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation UI: Add feedback message at the end of the curation Đang mở

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#265 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation UI: load only structure channel in the raw image if the image is a multi-channel file Đang mở

needs clarification UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#266 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation UI: Behaviors related to [Delete] mask button click Đang mở

medium priority needs clarification UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#267 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Bug: Curation UI: [raw] image loaded incorrectly Đang mở

bug needs clarification UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#268 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation UI: Mask section updates Đang mở

medium priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#269 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
UX: Curation UI: Make [Save] mask button more prominent Đang mở

UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#270 · 1 bình luận · 0 reaction · 2 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation UI: Design: Add [Save Progress] function to save out CSV Đang mở

medium priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#271 · 4 bình luận · 0 reaction · 2 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Training UI: Update Training Images section Đang mở

medium priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#272 · 2 bình luận · 0 reaction · 2 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
UX: Training UI: Display model stats upon training completion Đang mở

low priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#273 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Prediction UI: Remove Pre/Post Processing section Đang mở

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#274 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
UI/UX: Update text throughout the plugin Đang mở

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#275 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
TBD: Display result images from Prediction UI for on-screen image Đang mở

medium priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#276 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
UX: Test if models are platform dependent Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#277 · 2 bình luận · 0 reaction · 2 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Remove Channel Selection from Training & Curation UI for V1 Đang mở

UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#278 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Model Selection: Show/Hide tab modules depends on the user's selection Đang mở

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#279 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation UI: add a warning if user closes the plugin Đang mở

medium priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#280 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation: generate test and validation csv Đang mở

🚨 high priority🚨 needs clarification

AllenCell/allencell-segmenter-ml#281 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Training UI: warning message for CSV input Đang mở

needs prioritization UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#282 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Catch-all notes only Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#284 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Thao share training dataset w Brian Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#285 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Main screen: update disabled/hidden tabs state if a model has not been selected Đang mở

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#286 · 0 bình luận · 0 reaction · 2 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Training requires filters override Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#289 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Set num workers based on users # of available cores on cpu Đang mở

medium priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#290 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation record list changed directly in model state Đang mở

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#295 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026

AllenCell/allencell-segmenter-ml

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn