AaronRipleyQiagen / AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis
Write a function that takes a Gen2 data file to create summary tables
- Ngôn ngữ chính
- Jupyter Notebook
- Star
- 2
- Fork
- 1
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Mô tả
The summary table should include:
1. Total data points.
2. What type of assay.
3. Invalid rate in each category and combined. (UNR IND NR)
4. All systems that was used. Return a list of systems.
5. All cartridge that was used. Return a list of cartridges.
6. All cartridge that was used. Return a list of cartridges.
7. All module that was used. Return a list of modules.
Hướng dẫn đóng góp
Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này
Hướng nghiên cứu
Look for existing data processing functions in the repository to understand the Gen2 data file format. The function needs to parse the file, calculate totals and rates for categories UNR, IND, NR, and extract unique lists of systems, cartridges, and modules. Check for any tests or example notebooks to see how results should be structured.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Đánh giá
- Công nghệ
- python
- Lĩnh vực
- data
- Loại issue
- Tính năng
- Độ khó
- 3/5
- Thời gian dự kiến
- 1-2 ngày
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức phù hợp với người mới
- 45/100