AaronRipleyQiagen / AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis

Write a function that takes a Gen2 data file to create summary tables

Đang mở
#31 0 bình luận 0 reaction 1 người được giao Được @CaineS-Q nhận Xem trên GitHub
enhancement
Ngôn ngữ chính
Jupyter Notebook
Star
2
Fork
1
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

The summary table should include:
1. Total data points.
2. What type of assay.
3. Invalid rate in each category and combined. (UNR IND NR)
4. All systems that was used. Return a list of systems.
5. All cartridge that was used. Return a list of cartridges.
6. All cartridge that was used. Return a list of cartridges.
7. All module that was used. Return a list of modules.

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Hướng nghiên cứu

Look for existing data processing functions in the repository to understand the Gen2 data file format. The function needs to parse the file, calculate totals and rates for categories UNR, IND, NR, and extract unique lists of systems, cartridges, and modules. Check for any tests or example notebooks to see how results should be structured.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Đánh giá

Công nghệ
python
Lĩnh vực
data
Loại issue
Tính năng
Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức phù hợp với người mới
45/100

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.