AaronRipleyQiagen / AaronRipleyQiagen/NMDX-Data-Analysis
Write a function that takes a Gen2 data file to create summary tables
オープン
enhancement
- 主要言語
- Jupyter Notebook
- スター
- 2
- フォーク
- 1
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
説明
The summary table should include:
1. Total data points.
2. What type of assay.
3. Invalid rate in each category and combined. (UNR IND NR)
4. All systems that was used. Return a list of systems.
5. All cartridge that was used. Return a list of cartridges.
6. All cartridge that was used. Return a list of cartridges.
7. All module that was used. Return a list of modules.
コントリビューションガイド
このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません
調査の方向性
Gen2 のデータファイル形式を理解するために、リポジトリ内にある既存のデータ処理関数を探してください。この関数では、ファイルを解析し、カテゴリ UNR、IND、NR の合計値と割合を計算し、システム、カートリッジ、モジュールの一意なリストを抽出する必要があります。結果をどのような構造にすべきか確認するため、テストやサンプル notebook がないか確認してください。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
評価
- 技術スタック
- python
- 領域
- data
- issue の種類
- 機能追加
- 難易度
- 3/5
- 見積もり時間
- 1〜2日
- 活発さ
- 停滞
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 初心者へのやさしさ
- 45/100