scverse / scverse/spatialdata-plot
Interpolation problem for sparse image data?
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- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 86
- Fork
- 21
- Merge medio
- 14h 50m
- PR unite (30g)
- 3
Descrizione
While improving the Visium HD notebook after https://github.com/scverse/spatialdata-plot/issues/303 has been addressed I have noticed that there must be a problem with interpolations of images when the target canvas is small, because I can't replicate the plot shown in figure with the commented code (when I tried it shows everything black; if I put a large figsize e.g. (30, 30), I start seeing some white pixels).
To reproduce please run the Visium HD notebook.
Guida per i contributori
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Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
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- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Direzione di ricerca
Esegui il notebook Visium HD e ispeziona il codice di plotting commentato che produce un'immagine completamente nera con una canvas di destinazione piccola. Confrontalo con la figura allegata e con un figsize grande come (30, 30); il lavoro è completo quando l'interpolazione esegue il rendering dell'immagine in modo coerente anche sulla canvas più piccola.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Valutazione
- Stack tecnologico
- jupyter-notebook, python
- Ambito
- data-visualization
- Tipo di issue
- Bug
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Stato di attività
- Tranquilla
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Idoneità per principianti
- 48/100